双肾囊肿患者生存时间差异较大，多数单纯性肾囊肿不影响自然寿命，实际预后与囊肿类型、是否合并肾功能损害、基础疾病控制情况等因素相关。
单纯性肾囊肿进展缓慢，通常无须特殊治疗；多囊肾病可能导致肾功能进行性下降，需定期监测肾功能。
早期肾功能正常者预后良好；若出现血肌酐升高、肾小球滤过率下降，需通过控制血压、限制蛋白摄入延缓进展。
合并尿路感染时需及时抗感染治疗；囊肿出血或压迫症状明显者可考虑穿刺引流或手术治疗。
高血压和糖尿病会加速肾功能恶化，严格控制血糖血压可改善预后；遗传性多囊肾需进行家系筛查和遗传咨询。
建议每6-12个月复查泌尿系超声和肾功能检查，保持低盐优质蛋白饮食，避免剧烈运动导致囊肿破裂。
