苏合香丸具有温通开窍、行气止痛的功效，主要用于寒闭神昏、胸痹心痛等病症，其作用机制涉及芳香开窍、理气宽胸、散寒止痛、辟秽化浊四个方面。
苏合香丸中的苏合香、冰片等成分能兴奋中枢神经系统，适用于中风或气郁导致的突然昏厥，表现为牙关紧闭、四肢不温。可配合安宫牛黄丸等药物使用。
檀香、沉香等药材可调节冠状动脉血流，缓解心绞痛发作时的胸闷憋气，常与硝酸甘油片、复方丹参滴丸联用改善心肌缺血。
丁香、荜茇等温里药能抑制前列腺素合成，对寒邪引起的胃脘冷痛、痛经有效，可联合艾附暖宫丸、良附丸增强温经散寒效果。
木香、香附等成分可抑制肠道平滑肌痉挛，改善暑湿秽浊导致的腹痛吐泻，需注意与藿香正气水联用时应间隔两小时服用。
使用苏合香丸期间忌食生冷油腻，孕妇及热闭证患者禁用，出现皮疹或心悸等不良反应应立即停药就医。
