婴儿肝炎综合征多数情况下可以治愈，治疗效果与病因、病情严重程度、治疗时机等因素有关，主要治疗方法包括病因治疗、保肝治疗、营养支持等。
针对感染性病因可使用抗病毒药物如更昔洛韦、干扰素等，遗传代谢性疾病需特殊饮食或药物干预，胆道闭锁需手术解除梗阻。
使用护肝药物如还原型谷胱甘肽、腺苷蛋氨酸、熊去氧胆酸等改善肝功能，减轻黄疸症状，促进肝细胞修复。
提供高热量、适量蛋白、富含中链脂肪酸的特殊配方奶粉，补充脂溶性维生素A、D、E、K，必要时采用静脉营养支持。
针对凝血功能障碍补充维生素K或新鲜血浆，出现肝性脑病需降血氨处理，严重胆汁淤积可能需胆道冲洗或肝移植。
家长需定期监测生长发育指标，遵医嘱调整喂养方案，避免使用损伤肝脏的药物，多数患儿经规范治疗可获得良好预后。
