传染性软疣可能复发，复发概率与免疫力、治疗彻底性、接触传染源频率、皮肤屏障完整性等因素有关。
免疫功能较弱时病毒易再次激活，建议均衡饮食、规律作息，必要时遵医嘱使用免疫调节剂如胸腺肽、匹多莫德、转移因子。
未完全清除疣体可能导致残留病毒扩散，需由医生采用激光、冷冻或外用鬼臼毒素、咪喹莫特、水杨酸等药物规范治疗。
共用毛巾或密切皮肤接触可能再次感染，患者衣物需煮沸消毒，家长需避免儿童抓挠后接触健康皮肤。
湿疹或外伤部位易成为病毒入侵通道，合并皮炎时可联用莫匹罗星软膏预防感染，并保持患处干燥。
复发期间避免搔抓，贴身衣物单独清洗，儿童患者家长需定期检查皮肤状态并及时就医复诊。
