儿童血小板减少症多数可以根治，治疗效果与病因密切相关，主要治疗方式包括糖皮质激素治疗、免疫球蛋白输注、病因治疗及脾切除术。
泼尼松等糖皮质激素可抑制免疫反应，适用于免疫性血小板减少症，可能伴随皮肤瘀斑、鼻出血等症状，需监测血糖和骨密度。
静脉注射丙种球蛋白能快速提升血小板计数，用于急性出血或术前准备，可能出现头痛、发热等输注反应，需配合抗组胺药物使用。
继发于感染或药物者需消除诱因，如停用阿司匹林、控制EB病毒感染，伴随发热、乏力等症状，可配合利可君片等升血小板药物。
难治性病例可考虑脾脏切除，适用于年长儿童，术后需接种肺炎球菌疫苗，可能发生血栓或感染等并发症，需长期随访。
家长需定期监测血小板计数，避免剧烈运动，饮食注意补充富含维生素K的西蓝花、动物肝脏等食物，严格遵医嘱调整治疗方案。
