肝囊肿多数属于良性病变，体积较小时通常无须特殊治疗，较大囊肿可通过超声引导穿刺硬化、腹腔镜手术等方式消除。
直径小于5厘米且无症状的单纯性肝囊肿，建议每6-12个月复查超声监测变化，无须干预。
超声引导下穿刺抽液并注入无水乙醇，适用于5-10厘米囊肿，复发率约15％，可能与囊壁内皮细胞残留有关。
对巨大囊肿或合并感染出血者，可行腹腔镜去顶减压术，术中需注意胆漏风险，术后复发概率低于5％。
多囊肝患者出现压迫症状时，可采用开窗术建立囊腔-腹腔交通，需警惕术后腹水及感染等并发症。
日常避免肝区外伤，定期复查肝功能与超声，合并多囊肾者需同步监测肾功能变化。
