脑炎可能遗留后遗症，常见后遗症包括认知障碍、运动功能障碍、癫痫发作、语言障碍等，后遗症严重程度与脑损伤范围、治疗时机等因素相关。
病毒或细菌感染导致脑实质损伤可能影响记忆力和判断力，表现为注意力不集中或执行功能下降。早期康复训练结合多奈哌齐、美金刚等改善认知药物有助于功能恢复。
基底节或运动皮层受损可能导致偏瘫或共济失调，巴氯芬、替扎尼定等肌松剂配合物理治疗可改善肌张力异常。严重病例需进行神经修复手术。
脑炎后皮质瘢痕形成可能诱发癫痫，丙戊酸钠、左乙拉西坦等抗癫痫药物需长期服用。视频脑电图监测有助于评估发作类型。
优势半球颞叶损伤可能导致失语症，需进行语言康复训练。溴隐亭等神经递质调节剂可能改善语言流畅度。
脑炎患者应定期复查头颅影像学，保持均衡饮食并控制血压血糖，避免吸烟饮酒等加重神经损伤的行为。
