复方珍珠口疮颗粒可能引起口干、恶心、皮疹等副作用，严重时可能出现过敏反应或肝功能异常。该药物需在医生指导下使用，避免自行调整剂量。
药物成分中的清热燥湿类中药可能抑制唾液分泌，表现为口腔黏膜干燥。轻度症状可通过少量多次饮水缓解，严重者需医生评估是否调整用药方案。
部分患者服药后出现恶心、腹胀等消化道反应，可能与黄芩等苦寒成分刺激胃肠黏膜有关。建议餐后服用以减轻刺激，持续不适需考虑更换药物。
个别患者对珍珠粉等成分过敏，表现为皮肤瘙痒或红斑。发现过敏症状应立即停药，必要时遵医嘱使用氯雷他定等抗组胺药物。
长期大剂量使用可能影响肝脏代谢功能，表现为转氨酶升高。用药期间建议定期监测肝功能，发现异常需及时停用并配合保肝治疗。
服药期间避免辛辣刺激饮食，出现严重头晕、呼吸困难等症状应立即就医。儿童、孕妇及肝肾功能不全者用药前需严格评估风险收益比。
