双肾积水严重时需根据病因采取解除梗阻、控制感染、保护肾功能等综合治疗，主要方法有留置输尿管支架、经皮肾造瘘、手术矫正畸形、药物控制感染等。
急性梗阻导致的双肾积水可通过膀胱镜留置双J管引流尿液，适用于结石或肿瘤压迫输尿管的情况，需配合使用头孢曲松、左氧氟沙星等抗生素预防感染。
严重感染或输尿管完全梗阻时需行经皮肾穿刺造瘘，直接引流肾盂积液，术后需监测肾功能指标，必要时联合使用碳酸氢钠纠正代谢性酸中毒。
先天性肾盂输尿管连接部狭窄或前列腺增生患者需行肾盂成形术、前列腺切除术等，术后可能需长期服用坦索罗辛等α受体阻滞剂改善排尿功能。
合并尿路感染时需根据药敏结果选用呋喃妥因、磷霉素等敏感抗生素，伴有肾功能损害者需加用阿魏酸哌嗪等改善肾微循环的药物。
治疗期间需限制钠盐摄入，每日饮水量保持在2000毫升左右，定期复查超声监测积水变化，避免使用肾毒性药物。
