单纯性肾囊肿多数情况下不会自行消失，根据囊肿大小、位置及是否伴随症状等因素不同有不同处理方式。
1. 体积小
直径小于4厘米且无压迫症状的囊肿通常无须治疗，建议每6-12个月复查超声监测变化。
2. 体积大
超过5厘米或引起腰部胀痛的囊肿可考虑超声引导下穿刺抽液并注入硬化剂治疗，需排除多囊肾等疾病。
3. 并发症
合并感染时可出现发热、腰痛加剧等症状，需进行抗感染治疗，必要时行经皮肾镜引流术。
4. 特殊位置
肾门区囊肿压迫血管或集合系统时，可能需腹腔镜下去顶减压术，术后仍需定期随访。
日常生活中应避免腹部剧烈运动，控制血压在正常范围，每年进行泌尿系统超声检查随访囊肿变化。
