卵圆孔未闭可能引起偏头痛、短暂性脑缺血发作、脑卒中和反常性栓塞等危害，多数情况下无需治疗，严重时需手术干预。
卵圆孔未闭可能导致血液微小栓子通过未闭的卵圆孔进入脑部血管，引发偏头痛。偏头痛表现为单侧或双侧头部搏动性疼痛，可能伴随恶心呕吐。治疗可遵医嘱使用布洛芬、对乙酰氨基酚或曲普坦类药物缓解症状。
卵圆孔未闭患者易发生短暂性脑缺血发作，表现为突发性短暂神经功能缺损，如肢体无力或言语障碍。这种情况与微小血栓通过卵圆孔有关。治疗需使用阿司匹林、氯吡格雷等抗血小板药物，必要时进行抗凝治疗。
卵圆孔未闭增加隐源性脑卒中风险，尤其年轻患者中更常见。脑卒中可能导致肢体瘫痪、言语障碍等严重后遗症。治疗需紧急溶栓或取栓，长期预防可使用华法林、达比加群等抗凝药物。
卵圆孔未闭可能引起静脉系统血栓进入动脉循环导致反常性栓塞，严重时可危及生命。这种情况需要紧急治疗，包括溶栓、手术取栓或卵圆孔封堵术。预防可使用低分子肝素、利伐沙班等抗凝药物。
卵圆孔未闭患者应避免剧烈运动和潜水等可能增加右心压力的活动，定期进行心脏超声检查，出现神经系统症状及时就医。
