新生儿服用茵栀黄后大便通常呈黄绿色或深绿色，可能伴随少量黏液，主要与药物代谢产物刺激肠道、胆红素排泄增加、胃肠蠕动加快、个体吸收差异等因素有关。
茵栀黄中的黄芩苷等成分经肠道细菌分解后产生有色代谢物，直接导致大便颜色变深，这种改变无须特殊处理，停药后可逐渐恢复正常。
药物促进胆红素通过胆汁排泄，使粪便内胆红素氧化产物增多，家长需注意观察是否伴有皮肤黄染加重，若出现需及时复查胆红素水平。
茵栀黄可能加速肠内容物通过速度，使胆汁未充分分解即排出，建议家长记录排便频率，若每日超过5次稀便需联系医生调整用药。
不同新生儿对药物成分的吸收转化能力不同，早产儿可能出现更显著的便色改变，通常伴有排便次数增多现象。
家长需每日拍照记录大便颜色变化，同时观察喂养状态及体重增长情况，若出现陶土色便或血便应立即停药并就医，哺乳期母亲应避免进食辛辣刺激食物。
