癫痫灶切除手术的禁忌症主要有病灶位于重要功能区、多灶性癫痫、全身性癫痫发作、合并严重基础疾病等。
当致痫灶位于大脑语言、运动、感觉等重要功能区时，手术可能导致不可逆的神经功能缺损，需通过术前功能评估严格筛选病例。
存在两个及以上独立致痫灶的患者手术效果较差，这类患者通常建议采用迷走神经刺激术等替代治疗方案。
全面性癫痫发作而非局灶起源者不适合切除手术，这类患者需以药物治疗为主，必要时考虑生酮饮食等辅助疗法。
合并严重心肝肾疾病、凝血功能障碍或全身感染等基础疾病者手术风险过高，需先控制基础病情再评估手术可行性。
癫痫患者术前需完成视频脑电图、功能核磁等系统评估，术后仍需长期服用抗癫痫药物并定期复查脑电图。
