椎间孔镜治疗腰椎间盘突出的风险主要包括神经损伤、感染、硬膜撕裂、术后复发等，整体属于微创手术中安全性较高的术式。
术中器械操作可能刺激神经根，导致短暂性麻木或肌力下降，发生率较低，多数可自行恢复。
穿刺通道可能引发椎间隙感染，表现为术后发热、腰痛加剧，需抗生素治疗，严格无菌操作可有效预防。
椎管内操作可能导致脑脊液漏，引发体位性头痛，通常通过卧床休息和补液可缓解，极少需手术修补。
残留髓核组织可能再次突出，复发概率与患者术后康复锻炼及生活方式密切相关，需避免久坐和负重。
术后需遵医嘱佩戴腰围保护，逐步进行核心肌群训练，三个月内避免剧烈运动和重体力劳动。
