菠萝过敏可通过削皮浸泡、加热处理、控制食用量、避免空腹食用等方式预防，过敏体质者可遵医嘱服用氯雷他定、西替利嗪、地氯雷他定等抗组胺药物。
菠萝含菠萝蛋白酶易致敏，削皮后切块用淡盐水浸泡20分钟可分解部分致敏蛋白，降低过敏概率。
高温会破坏菠萝中菠萝蛋白酶活性，将菠萝加热至60℃以上制作成菠萝饭、菠萝酱等可减少过敏风险。
首次尝试菠萝者少量食用50克以内，观察无口唇发麻等过敏反应后再增量，每日建议不超过200克。
空腹时胃肠黏膜更易受菠萝蛋白酶刺激，建议餐后1小时食用，搭配乳制品可进一步中和酸性物质。
既往有水果过敏史者应谨慎食用菠萝，出现皮肤瘙痒、喉头水肿等严重过敏反应需立即就医。
