乙肝解毒胶囊可能引起胃肠道不适、肝功能异常、过敏反应、血液系统异常等副作用，需在医生指导下使用。
部分患者服药后可能出现恶心、腹胀或腹泻，与药物刺激胃肠黏膜有关，症状较轻时可调整服药时间或配合护胃药物如铝碳酸镁、硫糖铝、雷尼替丁。
长期使用可能引发转氨酶升高，与药物代谢增加肝脏负担相关，需定期监测肝功能，必要时联用护肝药物如甘草酸二铵、水飞蓟素、双环醇。
少数患者会出现皮疹或皮肤瘙痒，属于药物过敏反应，应立即停药并抗过敏治疗，可选用氯雷他定、西替利嗪、地塞米松。
极个别病例报告血小板减少，可能与免疫调节作用有关，需复查血常规，必要时使用重组人血小板生成素、利可君、氨肽素等药物干预。
服药期间避免饮酒及辛辣食物，出现严重不良反应应及时就医调整治疗方案。
