臭氧治疗阴道炎并非根治方法，阴道炎的治疗需根据具体病因选择抗真菌药物、抗生素或调节菌群药物，臭氧仅作为辅助物理治疗手段。
臭氧具有短暂抑菌效果，可能暂时缓解外阴瘙痒等症状，但无法穿透阴道黏膜深层杀灭病原体，治疗需配合药物。
外阴阴道假丝酵母菌病需使用克霉唑栓、硝酸咪康唑栓等抗真菌药物，臭氧无法破坏真菌细胞壁结构。
细菌性阴道病应使用甲硝唑栓、克林霉素磷酸酯凝胶，臭氧对厌氧菌抑制作用有限，过度使用可能破坏正常菌群。
滴虫性阴道炎需口服甲硝唑片联合阴道栓剂，臭氧不能杀灭隐藏在腺体中的滴虫，单用易导致复发。
治疗期间避免频繁阴道冲洗，选择纯棉内裤并煮沸消毒，性伴侣需同步检查治疗以防交叉感染。
