多数鼻窦囊肿无需手术可自行消退，但需定期复查。鼻窦囊肿的处理方式主要有观察随访、药物治疗、手术治疗、中医调理。
体积较小的无症状囊肿通常建议每半年复查鼻窦CT，监测囊肿变化。多数生理性黏液囊肿可能随鼻腔分泌物排出而缩小。
合并感染时可使用桉柠蒎肠溶软胶囊促进黏液溶解，配合布地奈德鼻喷雾剂减轻黏膜水肿，急性期需加用阿莫西林克拉维酸钾抗感染。
直径超过10毫米且引发头痛、视力障碍的囊肿需行鼻内镜下囊肿开放术。手术适应证与囊肿位置及并发症密切相关。
苍耳子散加减方有助于改善鼻腔通气，辛夷花代茶饮可辅助缓解鼻塞症状，但须在中医师指导下辨证使用。
日常避免用力擤鼻及鼻腔刺激，保持环境湿度适宜，出现持续头痛或视力变化应及时耳鼻喉科就诊。
