慢性扁桃体炎可通过阿莫西林、头孢呋辛、青霉素V钾片等药物治疗，也可配合西地碘含片缓解局部症状。
细菌感染引起的慢性扁桃体炎需使用抗生素，阿莫西林可抑制链球菌生长，头孢呋辛对耐药菌株有效，青霉素V钾片适用于青霉素敏感菌株。
西地碘含片含聚维酮碘成分，能减轻咽部肿胀和疼痛，地喹氯铵含片具有局部抗菌作用，溶菌酶含片可分解细菌细胞壁。
蓝芩口服液含板蓝根等成分，具有抗病毒作用，蒲地蓝消炎口服液适用于热毒壅盛型咽痛，金嗓利咽丸可缓解痰瘀互结症状。
细菌溶解产物胶囊可增强黏膜免疫力，匹多莫德口服液调节免疫功能，适用于反复发作的慢性扁桃体炎患者。
慢性扁桃体炎急性发作期需足疗程用药，日常保持口腔清洁，避免辛辣刺激食物，反复化脓感染者建议耳鼻喉科评估手术指征。
