支原体感染后不治疗可能发展为上呼吸道感染、支气管炎、肺炎等，严重时可能引发心肌炎、脑膜炎等并发症。
支原体感染初期可能仅表现为咽痛、鼻塞等上呼吸道症状，可通过多饮水、休息缓解，必要时可遵医嘱使用阿奇霉素、罗红霉素、克拉霉素等大环内酯类药物。
感染向下蔓延可能导致咳嗽加剧、咳痰等支气管炎表现，需避免冷空气刺激，可配合雾化治疗，药物选择包括左氧氟沙星、莫西沙星等喹诺酮类。
未及时控制可能进展为支原体肺炎，出现持续高热、胸痛，胸片显示肺部浸润影，需住院静脉滴注多西环素或联合糖皮质激素治疗。
少数患者可能并发心肌损伤或神经系统症状，与免疫反应过度激活有关，需进行心电图、脑脊液检查，严重时需免疫球蛋白冲击治疗。
支原体感染具有自限性但病程较长，建议出现症状后及时就医，治疗期间保持室内通风，避免剧烈运动加重心肺负担。
