肺真菌感染可能由免疫力低下、长期使用抗生素、环境暴露、基础肺部疾病等原因引起，可通过抗真菌药物、支持治疗、环境控制、原发病管理等方式治疗。
艾滋病、糖尿病或长期使用免疫抑制剂可能导致免疫功能受损，增加念珠菌、曲霉菌感染风险，表现为咳嗽、发热、胸痛，需使用氟康唑、伊曲康唑、两性霉素B治疗。
广谱抗生素破坏菌群平衡后易继发肺隐球菌病，常见咳血痰、呼吸困难，建议停用非必要抗生素并采用伏立康唑、卡泊芬净、米卡芬净干预。
接触霉变谷物或禽类粪便可能吸入组织胞浆菌孢子，引发肉芽肿性病变伴体重下降，需脱离污染环境并使用酮康唑、泊沙康唑、氟胞嘧啶治疗。
慢性阻塞性肺疾病或肺结核患者易合并曲霉菌球，典型症状为反复咯血，需控制原发病同时考虑手术切除或使用艾沙康唑、特比萘芬、阿尼芬净。
保持居所通风干燥，避免接触腐败有机物，高危人群可定期进行胸部CT筛查，所有抗真菌药物均需在医生指导下规范使用。
