结膜炎严重时可能导致角膜炎、角膜溃疡甚至视力损伤，常见发展路径为充血水肿→分泌物增多→角膜受累→继发感染。主要有细菌性结膜炎、病毒性结膜炎、过敏性结膜炎、自身免疫性结膜炎。
结膜炎症蔓延至角膜时会出现畏光流泪，可能与金黄色葡萄球菌感染或疱疹病毒有关，表现为角膜混浊，可使用左氧氟沙星滴眼液、阿昔洛韦滴眼液、重组人表皮生长因子滴眼液。
严重感染会导致角膜组织缺损，疼痛剧烈伴视力下降，常见于铜绿假单胞菌感染或长期激素使用，需用伏立康唑滴眼液、妥布霉素地塞米松眼膏、小牛血去蛋白提取物眼用凝胶。
慢性炎症引发结膜与眼球黏连，影响眼球转动，多发生于重症多形红斑或化学伤后，需手术分离配合典必殊眼膏、玻璃酸钠滴眼液、环孢素滴眼液治疗。
角膜瘢痕或继发性青光眼可造成永久性视功能损害，常见于未规范治疗的衣原体结膜炎或真菌感染，需用那他霉素滴眼液、布林佐胺滴眼液、曲伏前列素滴眼液控制。
发生眼睑肿胀或视物模糊应立即就诊，日常避免揉眼并定期更换毛巾枕套，过敏体质者需远离花粉宠物毛发等致敏原。
