脑寄生虫病后遗症的治疗效果与损伤程度相关，部分患者可通过抗寄生虫治疗、神经修复治疗、康复训练及心理干预改善症状，严重神经损伤可能遗留永久性功能障碍。
针对残留虫体使用阿苯达唑、吡喹酮等驱虫药物，需配合糖皮质激素减轻炎症反应，治疗期间需监测肝肾功能及颅内压变化。
应用神经营养药物如鼠神经生长因子、甲钴胺等促进受损神经修复，对于癫痫发作患者需长期服用卡马西平等抗癫痫药物控制症状。
运动功能障碍者需进行肢体功能锻炼，语言认知障碍者接受专业康复治疗，康复周期通常需要数月到数年。
遗留精神行为异常的患者需配合认知行为治疗，抑郁焦虑症状明显者可短期使用舍曲林等抗抑郁药物。
建议定期复查头颅影像学评估病情，保持均衡饮食并适度运动，避免高脂饮食及酒精摄入以免加重神经损伤。
