脑炎患者进行骨髓穿刺可能出现短暂疼痛、局部出血或感染等后遗症，严重情况下可能引发神经损伤或慢性疼痛。后遗症发生概率与操作规范、个体体质等因素相关。
穿刺部位可能出现持续数天的钝痛，通常可通过冷敷或遵医嘱使用对乙酰氨基酚等镇痛药物缓解。
凝血功能异常者可能出现皮下淤血或血肿，压迫止血后多数可自行吸收，严重时需维生素K等药物治疗。
消毒不严格可能导致局部红肿热痛，需使用头孢曲松等抗生素治疗，同时监测体温变化。
极少数情况下可能损伤坐骨神经，表现为下肢麻木或肌力下降，需营养神经药物如甲钴胺配合康复训练。
术后保持穿刺部位清洁干燥，避免剧烈运动，出现持续发热或活动障碍需立即就医复查影像学检查。
