杞菊地黄丸可能引起口干、轻微腹泻、食欲减退、过敏反应等副作用，具体表现因人而异。
该药含熟地黄等滋腻成分，可能抑制唾液分泌。出现后可减少单次服用量，或配合麦冬、石斛等生津药材。
方中山茱萸具有收敛作用，部分人群可能出现胃肠不适。轻度腹泻时可暂时停药观察，持续腹泻需就医排除其他病因。
牡丹皮等成分可能影响消化功能。建议饭后服用，配合山楂、陈皮等开胃食物缓解症状。
极少数对菊花或枸杞过敏者可能出现皮疹瘙痒。应立即停药并服用抗组胺药物如氯雷他定、西替利嗪、地氯雷他定。
服药期间忌食辛辣刺激食物，出现严重不良反应应及时停用并咨询中医师。长期服用需定期监测肝肾功能。
