咪喹莫特乳膏主要用于治疗外生殖器和肛周尖锐湿疣，也可用于其他皮肤疣类疾病。该药物通过激活局部免疫反应抑制病毒增殖，属于免疫调节剂。
咪喹莫特乳膏是治疗人乳头瘤病毒引起的尖锐湿疣的常用药物。尖锐湿疣多发生于外生殖器及肛周，表现为菜花状或乳头状赘生物。咪喹莫特乳膏通过刺激机体产生干扰素等细胞因子，增强局部免疫功能，从而达到清除病毒的目的。使用过程中可能出现红斑、糜烂等局部反应，需遵医嘱调整用药频率。
咪喹莫特乳膏对由HPV3、10型引起的扁平疣也有一定疗效。扁平疣好发于面部和手背，表现为扁平丘疹。药物通过诱导角质形成细胞凋亡和促炎细胞因子分泌，帮助消除疣体。治疗期间需注意避免日晒，防止色素沉着。
咪喹莫特乳膏可用于治疗HPV2、4型引起的寻常疣。寻常疣常见于手指、足底等部位，表面粗糙呈乳头状。药物能促进疣体周围免疫细胞浸润，但对手足部位厚角质层的渗透性较差，常需配合水杨酸等角质溶解剂使用。
咪喹莫特乳膏对HPV16、18型相关的鲍温样丘疹病具有治疗作用。这种疾病表现为生殖器部位多发性红褐色扁平丘疹，具有癌变风险。药物通过调节局部免疫微环境，可降低病毒载量并促进皮损消退。
咪喹莫特乳膏对癌前病变光线性角化病也有应用价值。该病与长期紫外线暴露相关，表现为粗糙红斑或鳞屑斑。药物通过诱导肿瘤坏死因子等细胞因子产生，能促进异常角质形成细胞凋亡，但需警惕治疗中可能加重的炎症反应。
使用咪喹莫特乳膏期间应避免接触眼睛和黏膜，孕妇及哺乳期妇女慎用。治疗尖锐湿疣时建议配偶同时检查，防止交叉感染。用药部位出现严重红肿、溃疡时应暂停用药并就医。保持患处清洁干燥，避免搔抓，穿宽松棉质内衣减少摩擦。饮食宜清淡，适当补充维生素和优质蛋白以增强免疫力。
