克罗恩病活动期可通过营养支持、药物治疗、内镜治疗、手术治疗等方式控制。疾病活动期通常与免疫异常、肠道菌群紊乱、感染诱发、遗传易感性等因素相关。
全肠内营养有助于黏膜修复，可选择短肽型或整蛋白型配方。严重营养不良患者需静脉补充氨基酸、脂肪乳等。营养干预可能与肠道吸收障碍、进食不足等因素有关，通常表现为体重下降、低蛋白血症等症状。
糖皮质激素如泼尼松可快速控制急性炎症，免疫抑制剂如硫唑嘌呤用于维持缓解。生物制剂如英夫利西单抗针对肿瘤坏死因子起效。药物治疗可能与Th1/Th17免疫应答过度、细胞因子分泌异常等因素有关，通常表现为腹痛、腹泻、发热等症状。
球囊扩张术适用于局限性狭窄，支架置入可缓解梗阻症状。内镜下止血治疗用于活动性出血病例。内镜干预可能与纤维性狭窄、深溃疡形成等因素有关，通常表现为肠梗阻、黑便等症状。
肠段切除术用于穿透性病变或药物难治性病例，狭窄成形术保留肠管长度。急诊手术指征包括穿孔、大出血等并发症。手术干预可能与透壁性炎症、瘘管形成等因素有关，通常表现为剧烈腹痛、腹膜刺激征等症状。
治疗期间需监测体重和营养指标，避免高纤维及刺激性饮食，保持适度活动有助于肠道功能恢复。
