脑猪囊尾蚴病的临床表现包括头痛、癫痫发作、颅内压增高和精神行为异常等。症状严重程度与寄生虫数量、寄生部位及宿主免疫反应有关。
早期常见持续性或阵发性头痛，与囊尾蚴寄生引发脑膜刺激或局部炎症反应相关，可能伴随恶心呕吐。
进展期多出现局灶性或全身性癫痫，因囊尾蚴寄生皮质区导致异常放电，发作形式与寄生位置密切相关。
囊尾蚴阻塞脑脊液循环或形成占位效应时可出现视乳头水肿、喷射性呕吐，严重者发生脑疝。
终末期可能出现认知障碍、幻觉或人格改变，常见于脑实质多发包囊或脑室型感染。
出现不明原因神经系统症状需及时进行血清学及影像学检查，确诊后应避免生食猪肉并遵医嘱进行驱虫治疗。
