病毒性结膜炎可使用更昔洛韦滴眼液、阿昔洛韦滴眼液、干扰素α滴眼液、溴苄环己铵滴眼液等抗病毒药物，需在医生指导下使用。
更昔洛韦滴眼液通过抑制病毒DNA聚合酶发挥作用，适用于单纯疱疹病毒性角结膜炎，可能出现眼部刺痛等不良反应。
阿昔洛韦滴眼液对单纯疱疹病毒有高度选择性，能减轻病毒复制引起的充血水肿症状，使用后需注意过敏反应。
干扰素α滴眼液具有广谱抗病毒作用，可增强局部免疫力，适用于腺病毒等引起的流行性结膜炎，可能出现短暂烧灼感。
溴苄环己铵滴眼液通过改变病毒包膜结构抑制复制，对急性出血性结膜炎有效，使用时避免接触镜佩戴。
病毒性结膜炎具有传染性，患者应单独使用毛巾等物品，避免揉眼，症状加重或持续超过两周需复诊。
