多囊肾的治疗难度与疾病分期有关，早期可通过药物控制进展，晚期可能需要透析或肾移植。治疗方式主要有血压管理、囊肿减压术、并发症治疗及肾脏替代疗法。
多囊肾患者常合并高血压，需长期服用降压药如氨氯地平、缬沙坦或美托洛尔，控制血压可延缓肾功能恶化。
针对巨大囊肿引发疼痛或压迫时，可在超声引导下穿刺抽液或行腹腔镜去顶术，但需注意术后复发可能。
感染时使用左氧氟沙星等抗生素，血尿严重者应用止血药物，肾结石可考虑体外冲击波碎石。
终末期患者需血液透析或腹膜透析维持生命，符合条件者可选择肾移植，术后需长期服用免疫抑制剂。
日常需限制高盐高蛋白饮食，避免剧烈运动撞击腰部，定期监测肾功能和血压变化，出现发热或腰痛加剧应及时就医。
