长期使用盐水洗鼻可能引发鼻腔黏膜损伤、继发感染、电解质紊乱及中耳炎等问题。鼻腔冲洗过度会破坏黏膜屏障功能，高渗盐水可能导致细胞脱水，操作不当易引发逆行感染。
频繁冲洗会冲刷掉鼻腔保护性黏液层，导致纤毛运动障碍，表现为鼻干、灼痛。建议改用等渗盐水，每周使用不超过3次，出现出血时需停用。
冲洗器具消毒不彻底可能引发细菌感染，常见金黄色葡萄球菌定植。需使用灭菌蒸馏水配制盐水，冲洗后彻底晾干器具，出现脓性分泌物需就医。
长期使用高浓度盐水可能导致钠离子吸收过量，诱发高血压患者病情波动。肾功能不全者应避免自行调配盐水，建议选用成品生理盐水制剂。
冲洗压力过大会使液体经咽鼓管进入中耳，儿童更易发生急性中耳炎。冲洗时应保持低头体位，避免说话吞咽，出现耳闷胀感应立即停止。
鼻腔冲洗适用于过敏性鼻炎急性发作期，日常护理推荐使用海盐水喷雾，合并鼻窦炎或鼻息肉者需在耳鼻喉科指导下操作。
