吴茱萸具有温中散寒、疏肝止痛、降逆止呕等功效，主要用于治疗脘腹冷痛、呕吐吞酸、五更泄泻、头痛等病症。
吴茱萸辛热燥烈，可祛除脾胃虚寒，常用于脘腹冷痛、胃寒呕吐等病症。可配伍干姜、人参等药物使用。
本品能疏解肝经郁滞，缓解寒滞肝脉导致的疝气疼痛、经行腹痛等症，常配伍小茴香、川楝子等药物。
具有和胃降逆作用，适用于肝胃不和引起的呕吐吞酸，常配伍黄连、生姜等药材以增强止呕效果。
能温补脾肾阳气，治疗脾肾阳虚导致的五更泄泻，多与补骨脂、肉豆蔻等药物配伍使用。
应在中医师指导下辨证使用，阴虚火旺者忌服，服用期间注意忌食生冷油腻食物，孕妇慎用。
