根管治疗中超声震荡触碰根管壁可能导致根管壁穿孔或器械分离，但发生率较低。超声震荡是根管清理的常用辅助手段，操作不当可能损伤牙体组织。
超声震荡器械在根管内高频振动时，若过度加压或角度偏移，可能造成根管壁局部变薄甚至穿孔。穿孔表现为治疗中突然出血增多、患者疼痛加剧或器械进入深度异常。轻微穿孔可通过生物陶瓷材料修补，严重穿孔需结合显微根尖手术处理。操作时使用低功率设定、保持器械与根管走向一致可降低风险。
极少数情况下，超声器械尖端可能因金属疲劳发生分离，残留于根管内。此时需用显微镊或套管系统取出，无法取出时需评估残留物对预后的影响。规范操作前检查器械完整性、避免重复使用老化器械可预防该情况。现代镍钛合金超声器械柔韧性提升，显著降低了分离概率。
建议选择具有显微根管治疗经验的医师操作，术前通过锥形束CT评估根管形态。治疗后出现持续隐痛或咬合不适需及时复诊，必要时拍摄X线片排除并发症。日常避免用患牙咀嚼硬物，使用含氟牙膏维护牙齿强度。
