新生儿甲低复查通过率一般在90％以上。新生儿甲低筛查初筛阳性者需进一步复查，多数复查结果可排除疾病，仅少数确诊为先天性甲状腺功能减退症。
新生儿甲低筛查采用足跟血检测促甲状腺激素水平，初筛阳性可能受采血时间、标本污染或暂时性TSH升高等因素影响。复查通常在出生后2-4周进行静脉血检测，包括TSH和游离甲状腺素测定。早产儿、低出生体重儿及双胞胎可能出现暂时性TSH异常，这类情况复查通过率更高。母亲孕期碘缺乏或服用抗甲状腺药物可能导致新生儿一过性甲低，多数在复查时指标恢复正常。规范的复查流程可有效降低假阳性率，避免不必要的治疗干预。
确诊先天性甲低的患儿需终身服用左甲状腺素钠片，如左甲状腺素钠片剂、左甲状腺素钠口服溶液等。家长应定期带孩子复查甲状腺功能，根据结果调整药物剂量。日常需观察孩子食欲、排便及生长发育情况，发现异常及时就医。哺乳期母亲应保证碘摄入，可选择加碘食盐、海带等含碘食物。新生儿甲低筛查及复查是预防智力发育障碍的重要措施，家长应积极配合完成全部检查流程。
