HPV感染通常无法完全根治，但多数情况下不会复发。部分低危型HPV感染可能被人体免疫系统清除，高危型HPV感染可能长期存在并增加癌变风险。
低危型HPV感染如HPV6、HPV11等引起的尖锐湿疣，通过规范治疗可能达到临床治愈。治疗方式包括冷冻治疗、激光治疗或外用药物如咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等。治疗后需定期复查，避免复发。高危型HPV感染如HPV16、HPV18等与宫颈癌密切相关，可能长期潜伏在体内。即使通过治疗清除病毒，仍可能因再次感染或病毒未被完全清除而复发。定期进行宫颈癌筛查如TCT检查、HPV检测有助于早期干预。
极少数情况下，HPV感染可能反复发作或持续存在。免疫功能低下人群如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂者，病毒清除能力较差，复发概率较高。部分患者可能因治疗不彻底或再次接触病毒源导致复发。对于这类情况，需加强免疫调节治疗并密切随访。
预防HPV复发需注意增强免疫力、避免不安全性行为、接种HPV疫苗。建议保持规律作息、均衡饮食、适度运动，定期进行妇科检查。出现异常症状如异常阴道出血、皮肤黏膜新生物等应及时就医。
