头孢克肟通常不能治疗结膜炎。结膜炎的治疗需根据病因选择药物，头孢克肟作为第三代头孢菌素类抗生素，主要用于敏感菌引起的呼吸道、泌尿道等感染，对病毒性或过敏性结膜炎无效，对部分细菌性结膜炎也可能因病原菌不敏感而效果有限。
细菌性结膜炎常见病原体包括金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌等，头孢克肟对部分革兰阴性菌作用较强，但覆盖谱与结膜炎常见致病菌匹配度较低。临床更常使用左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等局部抗生素，直接作用于眼部感染灶。病毒性结膜炎多由腺病毒引起，需抗病毒药物如更昔洛韦眼用凝胶；过敏性结膜炎则需抗组胺药物如奥洛他定滴眼液。头孢克肟全身给药后眼内药物浓度较低，难以有效渗透至结膜组织。
若误用头孢克肟治疗结膜炎，可能延误病情或增加耐药风险。细菌性结膜炎伴随大量脓性分泌物时可短期使用抗生素眼膏，但需避免自行选用全身用抗生素。出现眼红、畏光、异物感等症状时，应及时就医明确病因，遵医嘱使用针对性眼用制剂，同时注意眼部清洁护理，避免揉眼或共用毛巾等交叉感染。
