气管溃疡的治疗难度与病情严重程度及个体差异有关，多数情况下通过规范治疗可以控制症状。
早期发现的气管溃疡通常对药物治疗反应良好。这类溃疡多由胃酸反流、长期吸烟或病原体感染引起，临床常用质子泵抑制剂如奥美拉唑肠溶胶囊抑制胃酸，配合硫糖铝混悬凝胶保护黏膜。对于感染性溃疡，医生可能开具阿莫西林克拉维酸钾片联合克拉霉素片进行抗感染治疗。患者症状多在2-4周内缓解，但需完成全程用药以防止复发。
病程较长或范围较大的溃疡可能存在治疗挑战。当溃疡深度超过黏膜下层或伴有气管狭窄时，除药物治疗外可能需要支气管镜下球囊扩张术。合并免疫缺陷、糖尿病等基础疾病者愈合速度较慢，需同时控制原发病。极少数顽固性溃疡可能需外科手术干预，但这种情况在临床占比不足百分之五。
气管溃疡患者应避免辛辣刺激食物，戒烟并保持环境湿度。治疗期间建议定期复查支气管镜评估愈合情况，出现咯血、呼吸困难等症状需立即就医。规范用药配合生活方式调整，多数患者预后良好。
