真菌肺炎通常可以治愈，但治疗周期较长且需根据具体病原体类型制定方案。真菌肺炎的治疗效果主要与患者免疫状态、感染菌种、用药依从性等因素相关。
真菌肺炎的治疗以抗真菌药物为核心。肺部念珠菌感染可选用氟康唑注射液、伏立康唑片或卡泊芬净注射液，疗程通常需要2-4周。肺曲霉病多采用伏立康唑片或两性霉素B脂质体，治疗周期可能延长至6-12周。对于隐球菌肺炎，初始治疗常联合使用两性霉素B注射液和氟胞嘧啶片，后续改用氟康唑胶囊维持治疗。治疗期间需定期复查胸部CT和真菌培养，评估病灶吸收情况。免疫功能正常者预后较好，而艾滋病、器官移植等免疫抑制患者可能需要更长期的抗真菌治疗。
部分特殊类型真菌感染治疗难度较大。如毛霉菌肺炎进展迅速，需联合两性霉素B脂质体静脉给药和手术清创，病死率较高。某些耐药性念珠菌感染对常规抗真菌药物反应差，可能需要更换为棘白菌素类新型药物。慢性空洞型肺曲霉病可能需持续用药超过6个月，部分病例会发展为需要手术切除的肺曲霉球。
治疗期间应保持充足营养摄入，每日饮水不少于1500毫升，避免高糖饮食加重真菌繁殖。注意监测肝功能指标，抗真菌药物可能导致转氨酶升高。出现咯血、呼吸困难加重等情况需立即就医。治愈后仍需定期随访，免疫缺陷患者可能需要二级预防用药。早期诊断和规范治疗是改善预后的关键因素。
