HPV感染后可能出现无症状携带、皮肤黏膜病变或癌变等不同情况，具体表现与病毒型别和机体免疫力有关。高危型HPV持续感染可能引发宫颈癌、肛门癌等恶性肿瘤，低危型多导致尖锐湿疣等良性病变。
HPV感染后约90％的病例可通过免疫系统在1-2年内自然清除，表现为短暂性感染。部分低危型HPV感染可能在外生殖器或肛周形成菜花状赘生物，即尖锐湿疣，常伴有瘙痒或出血。高危型HPV如16、18型若持续感染超过2年，可能引起宫颈上皮内瘤变，逐步发展为宫颈癌，早期多无典型症状，进展期可能出现接触性出血、异常排液。口腔HPV感染可能与口咽癌相关，表现为咽喉异物感或溃疡。男性感染者可能出现阴茎癌或肛门癌，但概率低于女性宫颈癌。
免疫功能低下者更易出现持续感染和病变进展。艾滋病患者、器官移植后服用免疫抑制剂者，HPV清除率显著降低，癌变风险增加。妊娠期女性因激素变化可能导致疣体快速增长。长期吸烟会抑制局部免疫力，加速宫颈病变恶化。遗传因素如HLA基因多态性也可能影响感染结局。
建议所有性活跃期女性定期进行宫颈癌筛查，包括HPV检测和TCT检查。发现高危型阳性需结合阴道镜评估，确诊癌前病变可采用激光、冷冻或宫颈锥切术治疗。尖锐湿疣可通过咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物或二氧化碳激光去除。接种九价HPV疫苗可预防约90％相关癌症，即使已感染仍建议接种以预防其他型别感染。日常需保持会阴清洁干燥，避免多个性伴侣，使用避孕套可降低传播风险。增强免疫力有助于病毒清除，需保证充足睡眠、均衡营养及适度运动。
