消化功能较弱者、肾病患者、糖尿病患者、过敏体质者及胃肠术后患者不宜吃黑米粥。黑米粥虽富含膳食纤维和矿物质，但部分人群食用后可能加重原有疾病或引发不适。
黑米粥含有较多粗纤维和抗性淀粉，消化功能较弱者如慢性胃炎患者、肠易激综合征患者食用后可能引发腹胀、腹痛。胃肠动力不足的老年人或术后恢复期患者也需谨慎，建议选择更易消化的精制米粥。
黑米中磷、钾含量较高，慢性肾病患者肾功能受损时难以代谢多余矿物质，过量摄入可能加重高磷血症或高钾血症。终末期肾病患者需严格限制黑米摄入，必要时在营养师指导下调整谷物种类。
黑米粥升糖指数虽低于白米粥，但经过长时间熬煮后淀粉糊化程度增高，仍可能导致餐后血糖波动。需胰岛素治疗的糖尿病患者应控制单次食用量，搭配蛋白质食物延缓糖分吸收。
黑米含有的麸质蛋白和花青素可能引发过敏反应，表现为皮肤瘙痒、口腔黏膜水肿等症状。既往对杂粮过敏者应进行食物不耐受检测，首次尝试黑米时需观察是否出现过敏反应。
胃大部切除或肠道手术后早期患者消化吸收能力下降，黑米粥的纤维成分可能刺激未完全愈合的消化道创面。建议术后1-3个月内选择低渣饮食，逐步过渡到全谷物饮食。
特殊人群食用黑米粥前建议咨询临床营养师，根据个体情况调整烹饪方式和食用量。健康人群也应注意避免空腹大量食用，可搭配鸡蛋、瘦肉等蛋白质食物提高营养利用率。黑米需充分浸泡后熬煮至软烂，减少胃肠刺激。若食用后出现明显不适，应及时停止进食并就医评估。
