长期大量食用芥菜可能引起胃肠不适或甲状腺功能异常，但适量食用通常安全。芥菜富含硫代葡萄糖苷、膳食纤维和维生素，过量摄入可能因成分刺激或营养失衡导致不良反应。
芥菜中的硫代葡萄糖苷在体内水解后可能抑制甲状腺对碘的摄取，长期过量食用可能干扰甲状腺激素合成，尤其对碘缺乏人群风险更高。这类人群可能出现甲状腺肿大、代谢减缓等症状，需注意控制摄入量并确保碘营养充足。高含量膳食纤维可能加重胃肠负担，引发腹胀、腹泻，胃肠功能较弱者应减少食用频率。芥菜草酸含量较高，长期过量可能增加肾结石风险，泌尿系统疾病患者需谨慎。
普通人群适量食用芥菜可获取维生素K、维生素C等营养素，建议每周食用不超过3次，每次100-150克。烹饪时焯水可减少部分草酸和硫苷类物质。甲状腺疾病患者、胃肠炎患者及肾结石高危人群应咨询医生或营养师调整饮食方案。日常饮食需保持多样化，避免单一蔬菜过量摄入。
建议将芥菜与含碘食物如海带、紫菜搭配食用，以降低甲状腺风险。出现持续消化不良、颈部肿胀或排尿异常时应及时就医。储存时避免高温潮湿环境以减少亚硝酸盐生成，隔夜凉拌芥菜不宜再食用。儿童及孕妇食用前应确保彻底加热，控制单次摄入量在50克以内。
