脑干梗塞能否治好与梗塞范围、治疗时机及个体差异有关，部分患者通过早期干预可显著改善预后，但严重梗塞可能导致不可逆损伤。
脑干梗塞的预后与发病后6小时内是否接受静脉溶栓或血管内取栓治疗密切相关。及时恢复血流可减少神经细胞坏死，患者可能出现吞咽困难、构音障碍等症状，但通过康复训练可逐步恢复部分功能。常用药物包括阿替普酶注射液、丁苯酞氯化钠注射液、依达拉奉注射液等，需在卒中单元由专业团队评估使用。高压氧治疗联合肢体功能锻炼有助于促进侧支循环建立。
当梗塞面积超过脑干截面积的50％或累及生命中枢时，即使积极治疗也可能遗留永久性残疾。这类患者往往出现持续昏迷、中枢性呼吸衰竭等严重症状，需要长期依赖呼吸机辅助通气。后期并发症如肺部感染、深静脉血栓形成会进一步影响康复进程，此时治疗重点转为预防并发症和维持生命体征稳定。
脑干梗塞患者应定期复查头颅磁共振，监测病情变化。家属需协助患者进行被动关节活动度训练，预防肌肉萎缩和关节挛缩。饮食上选择软质或糊状食物，避免呛咳引发吸入性肺炎。保持乐观心态，在康复医师指导下循序渐进地进行吞咽功能训练和语言康复治疗。
