巨结肠可通过肛门指诊、钡剂灌肠造影、直肠肛管测压、直肠黏膜活检、结肠传输试验等方式检查。巨结肠通常由先天性肠道神经节细胞缺失、后天性肠道炎症或机械性梗阻等原因引起。
肛门指诊是初步筛查巨结肠的常用方法，医生通过手指触诊可发现直肠壶腹部空虚感或狭窄段。先天性巨结肠患儿可能出现直肠内粪便潴留，但指诊时无法触及粪块。该检查无须特殊准备，但对高位巨结肠诊断价值有限。
钡剂灌肠造影能直观显示结肠形态异常，典型表现为狭窄段与扩张段之间的移行区。先天性巨结肠可见远端肠管狭窄近端扩张，后天性巨结肠可能出现全结肠扩张。检查前需清洁灌肠，婴幼儿需使用稀释钡剂。
直肠肛管测压通过检测肛门括约肌反射判断神经节细胞功能，先天性巨结肠患者直肠扩张时缺乏肛门内括约肌松弛反射。该检查对短段型巨结肠诊断准确性较高，检查时需向直肠气囊注气观察压力变化。
直肠黏膜活检是确诊先天性巨结肠的金标准，病理检查可见黏膜下层神经节细胞缺如。全层活检可发现肌间神经丛异常，但新生儿需谨慎操作避免穿孔。乙酰胆碱酯酶染色有助于显示增生神经纤维。
结肠传输试验通过追踪标记物排出情况评估结肠运动功能，巨结肠患者标记物滞留时间超过72小时。该检查适用于便秘患者鉴别诊断，需连续拍摄腹部X光片观察标记物分布。
疑似巨结肠患者应尽早就医，婴幼儿出现胎便排出延迟、腹胀呕吐需立即就诊。检查前避免自行使用泻药，成人患者需记录排便日记辅助诊断。日常饮食应保持足够膳食纤维摄入，先天性巨结肠确诊后需根据病情选择经肛门拖出术或肠造瘘术。
