军检通常不会专门检查是否做过飞秒激光手术，但飞秒激光手术的痕迹可能通过眼科专项检查被发现。
飞秒激光手术主要用于矫正近视、远视或散光，手术过程中会在角膜上留下微小的痕迹。常规军检的眼科检查主要关注视力是否达标，通常不会刻意筛查手术痕迹。若视力符合标准且无其他眼部疾病，一般不会影响体检结果。但部分特殊兵种或岗位可能要求更详细的眼科检查，此时手术痕迹可能被观察到。
角膜地形图、裂隙灯检查等专项眼科检查能清晰显示角膜形态改变，这类检查可能发现飞秒手术导致的角膜瓣愈合痕迹或切削痕迹。若军检包含此类深度检查项目，手术史被发现的概率会显著增加。此外，术后角膜厚度变薄等结构性改变也可能成为判断依据。
建议提前了解目标兵种的具体体检标准，术后恢复期间严格遵医嘱护理眼睛，确保视力稳定。参加军检时如实告知病史可避免后续纠纷，刻意隐瞒可能影响服役资格认定。
