眼结膜手术可能存在后遗症，但多数情况下症状轻微且可逆。常见后遗症包括干眼、异物感、结膜充血等，少数患者可能出现瘢痕形成或感染。手术效果与术前评估、术中操作及术后护理密切相关。
术后干眼是较常见的反应，由于手术可能暂时影响泪液分泌或分布，表现为眼睛干涩、灼热感，通常可通过人工泪液缓解并随恢复逐渐改善。异物感多与缝线刺激或结膜创面愈合有关，拆线后症状多能消失。结膜充血属于术后正常炎症反应，1-2周内会自行消退。部分患者可能出现轻微瘢痕增生，尤其在翼状胬肉切除术后，但一般不影响视力功能。感染风险较低，但需注意术后避免揉眼及保持眼部清洁。
少数情况下可能出现持续性角膜上皮缺损、结膜囊肿或睑球粘连等并发症。角膜上皮缺损多见于原有干眼症患者，需加强角膜修复治疗。结膜囊肿通常需手术切除。睑球粘连多因术中创伤较大或术后护理不当导致，需早期干预防止影响眼球运动。对于瘢痕体质患者，术后瘢痕增生风险略高，可能需辅助抗瘢痕治疗。
术后严格遵医嘱使用抗生素滴眼液预防感染，避免剧烈运动及游泳1个月。定期复查有助于早期发现并处理并发症。若出现持续眼痛、视力下降或分泌物增多等症状应及时就诊。多数后遗症通过规范治疗可有效控制，术前充分沟通及选择经验丰富的医生可降低风险。
