马皮包菌一般不建议食用。马皮包菌属于野生真菌，存在误食有毒品种的风险，且部分人群可能对其产生过敏反应。
野生真菌种类繁多，外观相似度高，普通民众难以准确辨别可食用品种与有毒品种。马皮包菌中可能混有剧毒鹅膏菌等致命品种，误食后会出现恶心呕吐、腹痛腹泻等胃肠症状，严重时可导致肝肾功能衰竭甚至死亡。新鲜野生菌在运输储存过程中可能因变质产生毒素，烹调不当也无法完全破坏毒素活性。部分人群食用后可能出现皮肤瘙痒、喉头水肿等过敏反应，过敏体质者风险更高。
个别地区存在食用特定品种马皮包菌的传统，但需由专业采集人员在特定季节采摘，并经过充分高温烹煮。此类情况需确保菌种来源绝对可靠，且须由有经验的人员进行处理。即使可食用品种也不建议儿童、孕妇、老年人及免疫力低下者尝试。
建议选择市售人工培育的食用菌类，如香菇、平菇等，其安全性经过严格检测。若误食野生菌后出现不适，应立即催吐并携带剩余菌样就医。日常饮食中应加强食品安全意识，避免采食来源不明的野生植物和菌类。
