先天性二尖瓣关闭不全的严重程度因人而异，轻中度患者通过规范治疗可长期生存，重度患者需手术干预以改善预后。未经治疗的重度患者生存期可能显著缩短，但及时手术修复或置换瓣膜后生存期可接近正常人群。
先天性二尖瓣关闭不全的预后与瓣膜病变程度、心脏功能状态及干预时机密切相关。轻度患者可能终身无明显症状，仅需定期随访观察，心脏超声检查显示左心室功能正常时，通常不影响自然寿命。中度患者可能出现活动后心悸、气短，需药物控制心衰症状并延缓病情进展，常用药物包括利尿剂呋塞米片、血管扩张剂硝酸异山梨酯片及β受体阻滞剂美托洛尔缓释片，规范治疗下多数患者生存期可达数十年。重度患者因血液大量反流导致左心室扩大和肺动脉高压，未经手术者5年生存率显著降低，但接受二尖瓣修复术或生物瓣置换术后，80％以上患者术后10年生存率与同龄健康人群无显著差异。
部分特殊病例预后较差，如合并严重左心室功能不全、肺动脉高压或遗传综合征的患者，即使接受手术也可能存在远期并发症风险。新生儿期即出现心力衰竭的危重病例，需紧急手术但术后存活率相对较低。合并马凡综合征等结缔组织疾病的患者，术后仍需长期监测主动脉病变进展。
建议患者每3-6个月复查心脏超声评估瓣膜功能和心室变化，避免剧烈运动加重心脏负荷。日常需限制钠盐摄入，预防呼吸道感染，出现呼吸困难加重或下肢水肿时立即就医。术后患者应严格遵医嘱服用华法林钠片等抗凝药物，定期监测凝血功能，维持国际标准化比值在目标范围内。
