毛囊炎可通过保持皮肤清洁、外用抗菌药物、口服抗生素、光动力治疗、手术引流等方式治疗，多数情况下能够根治。毛囊炎通常由细菌感染、真菌感染、物理刺激、化学刺激、免疫功能低下等原因引起。
毛囊炎患者需每日用温水及温和清洁剂清洗患处，避免使用刺激性洗护产品。清洗后保持皮肤干燥，减少汗液和皮脂堆积。避免搔抓或挤压毛囊炎部位，防止感染扩散。贴身衣物选择透气棉质材料，定期更换消毒。
细菌性毛囊炎可外用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等抗菌药物。真菌性毛囊炎需使用酮康唑乳膏、特比萘芬乳膏等抗真菌药物。药物应均匀涂抹于患处及周围皮肤，使用前需清洁双手。若出现皮肤过敏反应应立即停用。
严重或反复发作的细菌性毛囊炎需口服头孢氨苄胶囊、阿奇霉素片等抗生素。真菌性毛囊炎可口服伊曲康唑胶囊、氟康唑胶囊等抗真菌药物。用药期间需完成整个疗程，避免擅自停药导致耐药性。可能出现胃肠不适等副作用。
顽固性毛囊炎可采用红光或蓝光光动力治疗。该疗法通过特定波长光线杀灭病原微生物，同时刺激皮肤修复。治疗前需清洁患处，治疗时佩戴防护眼镜。可能出现暂时性皮肤发红或干燥，通常数日内自行缓解。
形成脓肿的严重毛囊炎需由医生进行切开引流。手术在局部麻醉下进行，排出脓液后放置引流条。术后每日换药，使用无菌敷料覆盖。避免伤口接触水，遵医嘱使用抗生素预防感染。疤痕体质者可能遗留轻微瘢痕。
毛囊炎患者应避免辛辣刺激性食物，多摄入富含维生素A、C的蔬菜水果。规律作息，保证充足睡眠。适度运动增强免疫力，但出汗后及时清洁皮肤。避免长时间接触油脂、化学物质等刺激物。症状持续或加重时应及时复诊，不可自行长期使用抗生素。特殊职业人群需做好职业防护，降低毛囊炎复发概率。
