骨肉瘤的预后情况与肿瘤分期、治疗反应及患者个体差异有关，早期发现并规范治疗的患者5年生存率较高，但晚期或转移性骨肉瘤预后较差。
骨肉瘤的预后受多种因素影响，其中肿瘤分期是关键因素之一。局限性骨肉瘤经过手术切除联合化疗，5年生存率可达较高水平。手术彻底切除肿瘤是治疗的核心，术前术后辅助化疗能有效控制微转移灶。对化疗敏感的患者预后明显优于化疗反应差者，化疗药物如甲氨蝶呤、顺铂、多柔比星等常用于治疗方案。肿瘤体积小、位于四肢远端、无病理性骨折的患者预后相对较好。年龄也是影响因素，儿童和青少年对化疗耐受性较好，预后优于成人。
发生转移的骨肉瘤预后显著恶化，尤其是肺转移患者生存率大幅降低。肿瘤对化疗耐药、手术无法完全切除、复发等情况都会导致预后不良。部分患者可能出现局部复发或远处转移，需密切随访。病理类型中，普通型骨肉瘤预后较特殊类型差。治疗过程中出现严重并发症如感染、化疗毒性反应等也会影响预后。基因检测显示某些分子标志物异常的患者可能预后不佳。
骨肉瘤患者治疗后需长期随访，定期进行影像学检查监测复发和转移。康复期应保持适度运动增强骨骼肌肉功能，但避免剧烈活动防止病理性骨折。饮食需保证充足蛋白质和钙质摄入，必要时补充维生素D。心理支持对改善患者生活质量很重要，可寻求专业心理咨询。出现骨痛、肿胀等异常症状应及时就医复查，不可自行判断病情。
