基孔肯雅热主要通过埃及伊蚊和白纹伊蚊传播。这两种蚊子是基孔肯雅病毒的主要传播媒介，叮咬感染者后再叮咬健康人群时可导致病毒扩散。
埃及伊蚊是热带和亚热带地区常见的蚊种，偏好栖息于城市环境，常在室内或容器积水中繁殖。其体表有银白色斑纹，白天活动频繁，叮咬高峰为清晨和黄昏。白纹伊蚊又称亚洲虎蚊，原分布于东南亚，现已在全球多地扩散。该蚊种体色深黑，带有显著白色条纹，适应力强，可在小型积水容器中繁殖，同样以白天叮咬为主。这两种蚊虫均通过刺吸式口器吸血传播病毒，病毒在其唾液腺内增殖后，再次叮咬时随唾液注入人体。基孔肯雅病毒不会通过人与人直接接触传播，蚊媒叮咬是唯一自然传播途径。在流行地区，雨季积水增多导致蚊虫密度升高时，疫情暴发风险显著增加。
预防基孔肯雅热需重点防控蚊媒滋生，清除居住区周边积水容器，使用纱窗蚊帐等物理屏障，外出时穿着浅色长袖衣物并涂抹驱蚊剂。出现突发高热、关节剧痛等症状且近期有疫区旅居史者，应及时就医并告知暴露史。目前尚无针对基孔肯雅热的特效抗病毒药物，治疗以缓解症状为主，疫苗仍处于研发阶段。
